Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBCCD1Q9NVR7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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