Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKDREJQ9NTG1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms