Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms