Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNX15Q9NRS6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms