Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms