Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRN3Q9H3W5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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