Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSX2Q9BZM3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms