Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms