Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms