Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTDSS2Q9BVG9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTDSS2Q9BVG9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms