Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF4Q9BUZ4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms