Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MESP1Q9BRJ9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms