Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms