Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms