Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms