Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms