Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms