Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGBD1Q96JS3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGBD1Q96JS3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms