Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms