Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APH1AQ96BI3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms