Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UTP4Q969X6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms