Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCC1Q92922 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCC1Q92922 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms