Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXB13Q92826 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms