Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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