Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PROM2Q8N271 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROM2Q8N271 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms