Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHA9Q7RTU4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHA9Q7RTU4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms