Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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USP43Q70EL4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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USP43Q70EL4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP43Q70EL4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP43Q70EL4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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USP43Q70EL4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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