Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL2Q6F5E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL2Q6F5E8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms