Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAPC4Q5SXM2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms