Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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