Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms