Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC93Q567U6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms