Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTDC1Q4AE62 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms