Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q499Y3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q499Y3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q499Y3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms