Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIS6

ZNF528, Zinc finger protein 528, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF528Q3MIS6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF528Q3MIS6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF528Q3MIS6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms