Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF8Q3BBV2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms