Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms