Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FXNQ16595 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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