Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NTRK3Q16288 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms