Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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