Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RYR3Q15413 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RYR3Q15413 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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