Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ARHGEF6Q15052 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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