Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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