Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTAN1Q13813 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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