Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MTMR3Q13615 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms