Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C1orf61Q13536 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms