Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAD4Q13485 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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