Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP140Q13342 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP140Q13342 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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