Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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