Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACACAQ13085 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACACAQ13085 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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